Il differenza fondamentale tra l'ipoclorito di calcio e l'ipoclorito di sodio è quello l'ipoclorito di calcio contiene due anioni di ipoclorito associati a un catione di calcio mentre l'ipoclorito di sodio contiene un anione di ipoclorito associato a un catione di sodio. In apparenza, l'ipoclorito di calcio è una polvere da bianca a grigia mentre l'ipoclorito di sodio è un solido giallo-verdastro con un odore dolce.
Il calcio e l'ipoclorito di sodio sono composti ionici contenenti un catione metallico e un anione derivato dal cloro. Il numero di anioni per catione di questi composti differisce l'uno dall'altro a seconda della valenza del catione metallico.