Il differenza fondamentale tra la deaminazione ossidativa e non ossidativa è che la deaminazione ossidativa avviene tramite l'ossidazione degli amminoacidi del gruppo amminico mentre la deaminazione non ossidativa avviene tramite reazioni diverse dall'ossidazione.
La deaminazione è, come descrive il nome, la rimozione di un gruppo amminico da qualsiasi molecola. Queste sono reazioni chimiche catalizzate dagli enzimi deaminasi. Nel nostro corpo, questo tipo di reazioni si verificano nel fegato e talvolta anche nei reni (es: deaminazione del glutammato nei reni). Lì, il gruppo amminico rimosso si converte in ammoniaca ed è escreto dal nostro corpo. Inoltre, ci sono quattro reazioni principali che avvengono come reazioni di deaminazione; sono ossidazione, riduzione, idrolisi e reazioni intramolecolari. Di queste, ad eccezione dell'ossidazione, altre reazioni sono reazioni non ossidative.