Il differenza fondamentale tra licheni e micorrize è quello il lichene è un'associazione mutualistica che esiste tra un'alga / cianobatterio e un fungo, mentre la micorriza è un tipo di associazione mutualistica che si verifica tra le radici di una pianta superiore e un fungo.
Il mutualismo è uno dei tre tipi di simbiosi che si verifica tra due diverse specie di organismi. A differenza degli altri due tipi, il mutualismo avvantaggia entrambi i partner che fanno parte dell'associazione. Licheni e micorrize sono due esempi comuni di associazioni mutualistiche. Entrambi sono rapporti ecologicamente importanti. Due parti del lichene sono le alghe o il cianobatterio e un fungo. D'altra parte, due parti delle micorrize sono radici di una pianta superiore e un fungo.