La differenza fondamentale tra complementazione e ricombinazione è quella la complementazione è la capacità di due mutanti in combinazione di ripristinare un fenotipo normale mentre la ricombinazione è lo scambio di materiale genetico tra cromosomi, con conseguente alterazioni fisiche dei cromosomi.
Complementazione e ricombinazione sono due concetti che producono organismi geneticamente diversi. La complementazione ripristina il fenotipo normale quando due mutanti si combinano mentre la ricombinazione dà origine a un organismo con un corredo genetico alterato a causa dello scambio di materiale genetico tra organismi.
