La differenza fondamentale tra sostanze organiche e inorganiche è che tutte le sostanze organiche contengono carbonio come componente essenziale mentre le sostanze inorganiche possono o meno contenere carbonio.
Il più delle volte, le sostanze organiche contengono carbonio, idrogeno e talvolta ossigeno, insieme a legami CH. Ma la maggior parte dei composti inorganici non contiene carbonio eccetto alcune sostanze come carbonati e cianuri che sono classificati come inorganici per ragioni storiche (i primi scienziati chiamavano questi composti come inorganici). Pertanto, la principale differenza tra sostanze organiche e inorganiche risiede nella composizione chimica della sostanza.