Il differenza fondamentale tra acido malico e acido maleico è quello l'acido malico è un acido dicarbossilico saturo, mentre l'acido maleico è un acido dicarbossilico insaturo.
L'acido malico e l'acido maleico sono acidi bicarbossilici. Ciò significa che questi composti contengono due gruppi carbossilici (-COOH) nella stessa molecola, attaccati a due diversi atomi di carbonio. La differenza tra acido malico e acido maleico sta nella saturazione (presenza di doppi o tripli legami significa insaturazione). Poiché l'acido maleico ha un doppio legame tra due atomi di carbonio, è un composto insaturo. Ma non ci sono doppi o tripli legami tra gli atomi di carbonio dell'acido malico.