Il differenza fondamentale tra accoppiamento e repulsione è quello l'accoppiamento si riferisce al collegamento di due alleli dominanti o due recessivi mentre la repulsione si riferisce al collegamento di alleli dominanti con alleli recessivi.
Sulla base dei suoi esperimenti, Gregor Mendel stabilì tre leggi dell'eredità: la legge del dominio, la legge della segregazione e la legge dell'assortimento indipendente. La legge dell'assortimento indipendente afferma che i geni per tratti diversi si segregano indipendentemente l'uno dall'altro durante la formazione dei gameti. Tuttavia, alcuni esperimenti mostrano un fallimento nell'assortimento indipendente di geni. Durante i test cross, i rapporti attesi non vengono osservati. Ciò è dovuto al collegamento genetico. L'accoppiamento e la repulsione sono due aspetti diversi del collegamento. L'accoppiamento si riferisce al collegamento di due alleli dominanti o due recessivi mentre la repulsione si riferisce al collegamento di alleli dominanti con alleli recessivi.