La differenza fondamentale tra il coefficiente di partizione vero e apparente è che il coefficiente di partizione reale è definito per un sistema unionizzato mentre il coefficiente di partizione apparente è definito per un sistema ionizzato.
I due termini coefficiente di partizione vero e apparente sono usati principalmente in chimica farmaceutica, per quanto riguarda la produzione di farmaci. Nel caso della ionizzazione del farmaco, il vero coefficiente di partizione fornisce la distribuzione del farmaco nel suo stato unionizzato mentre il coefficiente di partizione apparente fornisce la distribuzione del farmaco nel suo stato ionizzato.
