Transposon vs Retrotransposon
I trasposoni e i retrotrasposoni sono componenti genetici del DNA e ci sono grandi differenze tra loro. La presenza percentuale di questi materiali genetici varia a seconda delle specie e le loro funzioni determinano il destino dell'organismo con mutazioni e altri cambiamenti fenotipicamente importanti. I trasposoni e i retrotrasposoni sono geni o raccolte di determinati geni situati nei filamenti di DNA e le alterazioni delle loro posizioni sono state le cause principali di queste conseguenze. Tuttavia, questo articolo intende discutere brevemente le funzioni di questi geni e presenta un confronto tra trasposoni e retrotrasposoni.
Cos'è Transposon?
I trasposoni sono frammenti o segmenti interessanti di DNA con la capacità di cambiare la posizione del filamento di DNA sotto forma di meccanismo taglia e incolla. A causa di questa natura mobile dei trasposoni, questi sono noti come geni saltanti. I trasposoni sono di due tipi principali noti come trasposoni di classe I e trasposoni di classe II. Di solito, il tipo di Classe II è indicato come i trasposoni e il tipo di Classe I è indicato come i retrotrasposoni. I processi di taglio e incollaggio di segmenti mobili di DNA sono regolati dall'enzima trasposasi. L'enzima si lega a entrambe le estremità del trasposone e taglia i legami fosfodiestere del filamento di DNA, isola il trasposone, lo sposta nel sito target e si lega nella nuova posizione. Tuttavia, questo processo è interessante da capire,poiché alcuni trasposoni possono spostarsi solo in determinate posizioni solo a causa dell'incompatibilità delle sequenze di base con il sito di destinazione. I geni con un'estremità di un singolo filamento hanno la stessa sequenza di basi con l'altra estremità dell'altro filamento singolo sono trasposoni con bordi appiccicosi, perché quelli possono legarsi ai siti del filamento di DNA bersaglio con la stessa sequenza di basi delle estremità appiccicose. Tuttavia, questa mobilità dei geni può causare cambiamenti nel genotipo così come nel fenotipo dell'organismo. Gli scienziati hanno inventato i trasposoni e sono stati quindi resi disponibili alimenti e organismi geneticamente modificati secondo le personalizzazioni preferite. Colture agricole ad alta produttività, antibiotici con proprietà medicinali,gli animali da allevamento erano alcuni dei prodotti sviluppati in modo vantaggioso dopo l'invenzione dei trasposoni da parte di Barbara McClintock negli anni '40.
Cos'è Retrotransposon?
I retrotrasposoni sono i trasposoni di Classe I e questi si muovono attraverso il genoma attraverso il meccanismo di copia e incolla. Il meccanismo della mobilità dei retrotrasposoni coinvolge pochi passaggi importanti come la copia del segmento genico del filamento di DNA nell'RNA, il trasferimento della copia dell'RNA al sito target, la trascrizione della sequenza di RNA nel DNA utilizzando la trascrittasi inversa e l'inserimento del gene nella nuova posizione del filamento di DNA del genoma. Le due estremità di questi retrotrasposoni hanno solitamente lunghe ripetizioni terminali con circa 1000 paia di basi, e quelle sono usate come caratteristiche di identificazione di questi geni. Questi geni sono facilmente amplificati all'interno del genoma e la percentuale di retrotrasposoni nel genoma umano è di circa il 50%. Questi potrebbero essere abbastanza pericolosi in quanto il virus causale di AIDS, HIV,e il virus della leucemia a cellule T hanno i retrotrasposoni nei loro genomi di RNA. In realtà, questi virus possono legare i retrotrasposoni in qualsiasi sito dei filamenti di DNA umano con l'uso della trascrittasi inversa e dell'integrasi. L'enzima integrasi funziona allo stesso modo della trasposasi nei trasposoni di Classe II.
Qual è la differenza tra Transposon e Retrotransposon?
• I trasposoni sono geni di salto di Classe II mentre i retrotrasposoni rientrano nella categoria di Classe I.
• I trasposoni funzionano con l'enzima trasposasi mentre i retrotrasposoni funzionano con l'uso di due enzimi principali noti come trascrittasi inversa e integrasi.
• Le estremità terminali sono molto più lunghe nei retrotrasposoni che nei trasposoni.
• I trasposoni vengono tagliati dall'origine e incollati sulla destinazione; al contrario, i retrotrasposoni vengono copiati dall'origine nell'RNA e trascritti nel bersaglio.
• Lo spostamento dei retrotrasposoni coinvolge l'RNA ma non nei trasposoni.
