Il differenza fondamentale tra la configurazione R e S è che la configurazione R è la disposizione spaziale dell'isomero R, che ha la sua direzione relativa dell'ordine di priorità in senso orario mentre la configurazione S è la disposizione spaziale dell'isomero S che ha la sua direzione relativa di priorità ordine in senso antiorario. Qui, la direzione relativa dell'ordine di priorità è l'ordine discendente delle priorità dei sostituenti.
Gli isomeri R e S sono molecole organiche aventi un centro chirale, che è un atomo di carbonio a cui sono attaccati quattro diversi sostituenti. Questi sostituenti vengono elencati in base alla loro priorità (la priorità viene determinata utilizzando le regole CIP come descritto di seguito).
