La differenza chiave tra DNA procariotico ed eucariotico è che il DNA procariotico galleggia liberamente nel citoplasma mentre il DNA eucariotico si trova all'interno del nucleo.
Esistono due categorie principali di organismi viventi come i procarioti e gli eucarioti. Differiscono l'uno dall'altro per la loro organizzazione cellulare. Di conseguenza, i procarioti hanno una semplice organizzazione cellulare. Mancano di un nucleo e di organelli legati alla membrana. D'altra parte, gli eucarioti hanno un'organizzazione cellulare complessa. Hanno un vero nucleo che contiene DNA e anche organelli cellulari legati alla membrana. Tutti i procarioti sono unicellulari mentre gli eucarioti possono essere organismi unicellulari o multicellulari. I procarioti e gli eucarioti contengono principalmente genomi del DNA. Il loro DNA è confezionato in cromosomi. Poiché i procarioti non hanno un nucleo, il loro DNA galleggia liberamente nel citoplasma. Tuttavia, negli eucarioti, i cromosomi si trovano all'interno del nucleo. Quindi, la membrana nucleare racchiude tutto il DNA eucariotico.