Il differenza fondamentale tra protone ed elettrone è quello il protone è una particella subatomica che si trova nel nucleo di un atomo, mentre gli elettroni sono particelle che orbitano attorno al nucleo.
Gli atomi sono gli elementi costitutivi di tutte le sostanze esistenti. Un atomo contiene un nucleo, che ha protoni e neutroni. Gli elettroni circolano attorno al nucleo negli orbitali. Inoltre, ci sono altre piccole particelle subatomiche nel nucleo. La maggior parte dello spazio in un atomo è vuoto. Le forze attrattive tra il nucleo caricato positivamente (carica positiva dovuta ai protoni) e gli elettroni caricati negativamente mantengono la forma dell'atomo.