La differenza fondamentale tra allelopatia e antibiosi si basa sul tipo di effetto portato da ciascun fenomeno. L'allelopatia determina effetti sia positivi che negativi sulla relazione tra due o più organismi, mentre l'antibiosi determina effetti negativi su uno degli organismi coinvolti nella relazione.
La nutrizione gioca un ruolo importante nella sopravvivenza degli organismi. In quel contesto, la relazione tra organismi per il fabbisogno di nutrienti è vitale. Sia l'allelopatia che l'antibiosi sono relazioni che avvengono tra due o più organismi. Tuttavia, rispondono l'un l'altro in forme diverse.
