Il differenza fondamentale tra oomiceti e zigomiceti è che gli oomiceti non contengono chitina sulle loro pareti cellulari, invece contengono cellulosa, beta glucani e aminoacidi idrossiprolina mentre gli zigomiceti contengono chitosano sulle loro pareti cellulari. Un'altra differenza tra oomiceti e zigomiceti è che lo stato vegetativo degli oomiceti è diploide mentre gli zigomiceti sono aploidi o dikariotici.
Oomiceti e zigomiceti sono organismi eucarioti microscopici. Gli oomiceti assomigliano a veri funghi. Ma sono stampi ad acqua. Gli zigomiceti sono una delle principali classi di phylum Zygomycota che sono veri funghi. Sono funghi ambientali ubiquitari, saprofiti.
