La differenza chiave tra l'inibizione autogena e reciproca è quella l'inibizione autogena è la capacità di un muscolo di rilassarsi quando sperimenta un allungamento o una maggiore tensione mentre l'inibizione reciproca è il rilassamento dei muscoli su un lato di un'articolazione per accogliere la contrazione sull'altro lato di quel giunto.
I muscoli si allungano e si rilassano. Al fine di mantenere le contrazioni muscolari, ci sono meccanocettori presenti sulle cellule muscolari che inviano informazioni al nostro sistema nervoso centrale. Il fuso muscolare e l'organo tendineo del Golgi (GTO) sono due organi sensoriali del riflesso di stiramento. I muscoli si contraggono in risposta allo stiramento dei muscoli. GTO inibisce l'attivazione muscolare per diminuire la tensione di muscoli e tendini.
L'inibizione autogena e reciproca sono due tipi di rilassamenti riflessi che proteggono i muscoli da danni e lesioni. Il rilassamento dell'inibizione autogena è la capacità del muscolo di rilassarsi mentre sta sperimentando una maggiore tensione. È fatto dal GTO. Al contrario, il rilassamento dell'inibizione reciproca è il rilassamento del muscolo opposto quando il muscolo agonista subisce un allungamento.