La differenza fondamentale tra neurotrasmettitori e ormoni è che i neurotrasmettitori sono i messaggeri chimici utilizzati dal sistema nervoso per trasmettere l'impulso nervoso attraverso le sinapsi mentre gli ormoni sono i messaggeri chimici utilizzati dal sistema endocrino per stimolare o comunicare con cellule bersaglio specifiche.
Il sistema nervoso e il sistema endocrino sono sistemi di organi molto importanti nel nostro corpo che regolano varie attività. Entrambi i sistemi dipendono dal rilascio di sostanze chimiche speciali rispettivamente come neurotrasmettitori o come ormoni. Questi neurotrasmettitori e ormoni agiscono come messaggeri chimici e facilitano la trasmissione degli impulsi nervosi e la regolazione delle attività fisiologiche nel nostro corpo.