La differenza chiave tra la metafase 1 e 2 è quella nella metafase 1, i cromosomi omologhi si accoppiano sulla piastra della metafase mentre nella metafase 2, i singoli cromosomi si allineano sulla piastra della metafase.
La meiosi è il processo che converte una cellula diploide in quattro cellule aploidi durante la formazione dei gameti. È un processo importante poiché aumenta la diversità genetica tra la prole. La meiosi è vitale nella riproduzione sessuale a causa della sua importanza nella formazione delle cellule aploidi. La meiosi si verifica attraverso due divisioni nucleari successive chiamate meiosi I e meiosi II. Ogni divisione nucleare può essere nuovamente suddivisa in Prophase, Metafase, Anafase e Telofase. Quindi, la metafase è lo stadio della divisione cellulare in cui i cromosomi si dispongono lungo la piastra della metafase. La metafase 1 può essere trovata nella meiosi I mentre la metafase 2 può essere trovata nella meiosi II. Le metafase 1 e 2 sono diverse l'una dall'altra.