Il differenza fondamentale tra l'immunità mediata da cellule e quella mediata da anticorpi è che l'immunità mediata da cellule distrugge le particelle infettive tramite la lisi cellulare da parte delle citochine, senza la produzione di anticorpi, mentre l'immunità mediata da anticorpi distrugge i patogeni producendo anticorpi specifici contro gli antigeni.
L'immunità cellulo-mediata e l'immunità mediata da anticorpi sono due tipi di meccanismi di difesa primari che avvengono nel nostro corpo. L'immunità cellulo-mediata agisce contro i patogeni intracellulari. Quindi, agisce all'interno delle cellule infette e distrugge i patogeni rilasciando citochine. Al contrario, l'immunità mediata da anticorpi agisce contro i patogeni extracellulari producendo anticorpi contro gli antigeni presenti all'esterno delle cellule infette o che circolano liberamente nel sangue. Inoltre, i linfociti B svolgono principalmente l'immunità mediata da anticorpi mentre i linfociti T svolgono l'immunità cellulo-mediata.