Il differenza fondamentale tra mastigomycotina e zygomycota è quello mastigomycotina è un gruppo polifiletico di funghi che producono cellule flagellate e hanno rizoidi mentre lo zygomycota è una divisione di funghi che producono spore sferiche resistenti chiamate zigospore durante la riproduzione sessuale.
I funghi sono organismi eucarioti filamentosi appartenenti a Kingdom Fungi. Producono spore sia sessuali che asessuali. Possono essere saprofiti o parassiti. Esistono diversi tipi di gruppi fungini. I gruppi principali sono mastigomycotina, zygomycota, ascomycota, basidiomycota e deuteromycota. La mastigomicotina è costituita da funghi zoosporici di cui molti sono esclusivamente acquatici. I funghi Zygomycota sono funghi coniugativi che producono zigospore caratteristiche. I funghi Ascomycota sono funghi sac che producono una struttura simile a una sacca chiamata ascus. I funghi Basidiomycota producono una struttura a forma di mazza chiamata basidio. I funghi Deuteromycota sono funghi imperfetti, il che significa che hanno solo lo stato asessuato o miceliale.
