Il differenza fondamentale tra lentivirus e retrovirus è quello il lentivirus è un tipo di retrovirus mentre il retrovirus è un virus RNA che contiene l'enzima trascrittasi inversa per convertire il genoma dell'RNA in DNA prima dell'inserimento nell'organismo ospite.
Inoltre, i retrovirus sono un gruppo di virus che appartengono alla famiglia Retroviridae. In questa famiglia ci sono sette generi: Alpharetrovirus, Betaretrovirus, Gammaretrovirus, Deltaretrovirus, Epsilonretrovirus, Lentivirus e Spumavirus. Quindi, i lentivirus sono un tipo di retrovirus.