Il differenza fondamentale tra il sangue del cordone ombelicale e le cellule staminali del midollo osseo è che le cellule staminali del sangue del cordone sono le cellule ematopoietiche presenti nel cordone ombelicale del neonato dopo il parto mentre le cellule staminali del midollo osseo sono le cellule staminali presenti nel midollo osseo tessuto di individui.
Il trapianto di cellule staminali è una procedura terapeutica comune in cui un paziente riceve una dose di cellule che formano il sangue (staminali) per sostituire le proprie cellule distrutte dalla malattia o da altre procedure terapeutiche. Sia le cellule staminali del sangue del cordone ombelicale che le cellule staminali del midollo osseo hanno scopi terapeutici (trapianti). Quindi, un uso comune di queste cellule staminali è sostituire le cellule malsane con una sana. Clinicamente, le fonti più comuni di cellule sane sono le cellule del cordone ombelicale e le cellule del midollo osseo.